役立たずと言われたスキルメンテで俺は全てを、「魔改造」する！

個々人の持つスキルやステータスを調整する能力「スキルメンテ」を持つフィーグ。戦闘に直接関係しないスキルのため、役に立たないと勇者パーティを追放されてしまう。行き場をなくしたフィーグは、剣士の少女・リリアのスキルメンテをきっかけに新たな能力“改造”を手に入れた。リリアの能力が飛躍的に向上したのをきっかけに、訳ありな仲間たちの能力を改造していく！

妹アヤメの学園に向かったフィーグたち一行。そこで、フィーグはティアに「生徒のスキルがおかしくなっている」という相談を持ちかけられる。その異変に対処すべく、学園の生徒のメンテしているとミナという美少女に出会い……？ フィーグたちの周りはさらに賑やかに！！